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lnc2Cancer数据库有什么用

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lnc2Cancer是一个从文献中收集整理的人类lncRNA相关肿瘤信息的数据库，网址如下

http://www.bio-bigdata.net/lnc2cancer/

目前最新版本是v2.0, 相比v1.0, 收录的lncRNA数量，肿瘤亚型数量，lncRNA与肿瘤相关联的数量都显著增长，示意如下

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在该数据库中，将lncRNA与肿瘤的关系分成了以下类别

  1. Circulating lncRNA-cancer

  2. Prognositc lncRNA-cancer

  3. Drug resistant lncRNA-cancer

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根据患病与治疗的不同阶段，分成了肿瘤发生期，预后，抗药性3个方面；同时，还给出了文献中报导的，调控lncRNA的其他分子信息，包括以下几种

  1. TF

  2. miRNA

  3. variant

  4. methylation

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通过Browser功能，可以根据lncRNA或者cancer查看相关结果，以HOTAIR这个lncRNA为例，结果如下

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不仅给出了相关疾病的名称，文献，还给出了验证的方法，表达趋势等信息，点击details, 可以进一步查看具体的细节。

对于文献中采用的NGS数据，可以通过HIGH-THROUGHPUT查看，示意如下

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通过对应的GEO编号，可以下载到原始数据，可以方便我们基于别人已有的数据去进行分析。

该数据库的数据是免费下载的，示意如下

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相比lncrnadisease数据库，ln2Cacner专注肿瘤领域，而且做了细致的划分，同时也提供了相关的TF, miRNA, SNP,  甲基化等信息。

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