用R语言怎么画小提琴图

本篇内容介绍了“用R语言怎么画小提琴图”的有关知识，在实际案例的操作过程中，不少人都会遇到这样的困境，接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧！希望大家仔细阅读，能够学有所成！

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数据已经存储到了文件里首先是读取数据

library(readr)
df<-read_tsv("author_number.tsv")
head(df)

期刊分别是

table(df$journal)

首先通过summary()函数看一些数据的基本情况

summary(df)

作者数量最多的竟然有446人，中位数是6个人，符合日常认知

我们看一下400多个作者的论文是什么？


library(dplyr)

df%>%
  filter(auth_num == 446) -> df1

df1$id

这个应该是采集了很多人的数据，可能是把参与实验的所有人全都列成作者了

接下来就是小提琴图展示每个期刊作者数量的分布了

用原始数据作图代码和结果如下

ggplot(df, aes(x=journal, y=auth_num, fill=journal)) +
  geom_violin(scale="width") +
  geom_boxplot(width=.12, 
               fill=I("black"), 
               notch=T,
               outlier.size=NA, 
               col="grey40") +
  stat_summary(fun="median", 
               geom="point", shape=20, col="white") +
  #scale_y_log10(breaks=c(1:5, seq(10, 50, by=10), 100, 200, 300)) +
  coord_flip() + labs(x="", y="Number of authors per paper") +
  theme_classic() + theme(legend.position="none") +
  scale_fill_brewer()

这个结果不太好看，所有作者对原始数据做了log10转化

ggplot(df, aes(x=journal, y=auth_num, fill=journal)) +
  geom_violin(scale="width") +
  geom_boxplot(width=.12, 
               fill=I("black"), 
               notch=T,
               outlier.size=NA, 
               col="grey40") +
  stat_summary(fun="median", 
               geom="point", shape=20, col="white") +
  scale_y_log10(breaks=c(1:5, seq(10, 50, by=10), 100, 200, 300)) +
  coord_flip() + labs(x="", y="Number of authors per paper") +
  theme_classic() + theme(legend.position="none") +
  scale_fill_brewer()

log10转换是一种比较好的方案当数据有明显的离群值的时候

这次新学到的知识点包括

lappy()函数指定参数

lapply(files_all,
       read_tsv,
       col_type= list(
         col_character(),
         col_character(),
         col_character(),
         col_character())) %>%                
  bind_rows -> data_all

统计字符串中指定字符的数量

library(stringr)
str_count("A,B,C",pattern=",")

“用R语言怎么画小提琴图”的内容就介绍到这里了，感谢大家的阅读。如果想了解更多行业相关的知识可以关注创新互联网站，小编将为大家输出更多高质量的实用文章！

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用R语言怎么画小提琴图

这次新学到的知识点包括

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