linux：文本处理系列-1.行截取

（自己）常用的文本文件的行处理命令

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示例文件：test.vcf

1、head -n 10 test.vcf

head : 默认是提取文件的前10行，-n 参数可以设定选择文件的前n行

2、tial -n 10 test.vcf

tail : 默认是提取文件的末尾10行， -n 参数可以设定选择文件末尾的n行

3、sed -n '10,20p' test.vcf

sed -n ： 随意选择需要查看的行

sed命令是一个面向行处理的编辑器，可以和正则表达式配合使用，附上较全面的sed命令使用教程。

4、awk 截取行的指定长度字符串

less test.gz |awk '{if(NR%2==1){print}else{print substr($1,1,75)}}' | gzip -c test.part.gz

说明：对test.gz文件指定行截取75bp，原来是150bp

5、对n行的第三列求和，求平均值

grep -v ‘#’ test.vcf |sed -n '20,35p' |awk -F '\t' '{sum+=$3;n++}END{print sum,sum/n}'

(linux 一行命令计算速度比Python快，简单计算喜欢用linux命令)

记得随时整理使用过的命令，没学过linux，靠着各种帖子，随时需要随时补给，有点懒。

linux 剪切命令

1、在linux中的复制粘贴命令：在一行的任何位置按下yy,y是yanked拷贝的意思，然后去想粘贴的位置按下p即可。p是粘贴的意思。

2、如果想复制3行的话，按下3yy,就复制3行，如果想复制多行的话，直接按数字可以选中多好，然后粘贴。

3、剪切和粘贴：把光标移动到想剪切那一行的任意位置，按dd。后在想粘贴的位置按下p粘贴。

4、按下数字如3dd，剪切3行，然后去想粘贴的地方粘贴即可。

5、删除上面最后一行中的数字6，首先按下Ctrl+v,进入Visual Block模式（块选择模式），这是一种特殊的模式，允许选择多个字符。

linux文件截取前几行，后几行，中间几行命令及查看端口命令

1. 如果你只想看文件的前100行，可以使用head命令，如

head -100  filename

2. 如果你想查看文件的后100行，可以使用tail命令，如：

tail -100  filename 或 tail -n 100  filename

3. 查看文件中间一段，你可以使用sed命令，如：

sed -n '100,200p' filename 

这样你就可以只查看文件的第100行到第200行。

截取的文件可以用重定向输入到新的文件中：

head -100  filename a.txt

也可以在robot里面使用read 打印出来

使用命令：

ps -aux | grep tomcat/8080

方法二：直接使用 netstat   -anp   |   grep  portno

即：netstat –anp | grep 8080

查看端口命令

linux替换目录下所有文件中的某字符串

比如，要将目录/modules下面所有文件中的zhangsan都修改成lisi，这样做：

sed -i "s/zhangsan/lisi/g" `grep zhangsan -rl /modules`

解释一下：

-i 表示inplace edit，就地修改文件

-r 表示搜索子目录

-l 表示输出匹配的文件名

linux查找目录下的所有文件中是否含有某个字符串

查找目录下的所有文件中是否含有某个字符串

find .|xargs grep -ri "php"

查找目录下的所有文件中是否含有某个字符串,并且只打印出文件名

find .|xargs grep -ri "php" -l

ip addr  查看ip地址

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