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R语言tableone包怎么使用

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用一个例子看一下：

输入1：

# 初次使用请先安装install.packages('tableone')# 安装后调用 # 查看一下数据集 head(dt,10)  # 数据集是小编随机编造的虚拟数据

输出1：

# A tibble: 10 x 9   性别   年龄 是否饮酒 病理类型 分化程度   ALT   AST  检测 Group                       1 女       44 是       病理类型 I型       22    21    8.29 实验组 2 女       52 是       病理类型 I型       24    24    4.7  实验组 3 男       55 否       病理类型 I型       30    32.3  6.8  实验组 4 男       50 否       病理类型 I型       20    16    4.16 实验组 5 女       64 是       病理类型 I型       13     8   10    实验组 6 女       24 是       病理类型 I型       14.6  10.8 15    实验组 7 男       66 否       病理类型 I型       51.6  22.3  8.32 实验组 8 女       43 是       病理类型 I型       21    25   10.2  实验组 9 女       52 是       病理类型 I型       16    18   10.2  实验组10 女       44 是       病理类型 I型       19.9  13.2 11.9  实验组

输入2：

library(tableone)dput(names(dt))  # 查看数据的变量名

输出2：

c("性别", "年龄", "是否饮酒", "病理类型", "分化程度", "ALT", "AST", "检测", "Group")

输入3：

# step1 创建对象tab1 <- CreateTableOne(  vars = c("性别", "年龄", "是否饮酒", "病理类型",             "分化程度", "ALT", "AST", "检测"), # 所有要逆袭额变量  strata = "Group",  # 指定分组  data = dt,  # 指定数据集  factorVars = c("性别","是否饮酒","病理类型","分化程度")  # 指定分类变量  )# step2 生成结果print(tab1,      nonnormal = "检测", # 指定不符合正态性检验的连续变量      exact = '是否饮酒', # 需要用fisher确切概率法的变量      showAllLevels = TRUE, # 展示多分类变量所有 level      pDigits = 3,   # P值小数点后的位数      quote = TRUE  #  粘贴进入excel，分列即可。)# 完毕

连续变量默认正态，可以通过nonnormal指定为非正态。分类还可以通过exact指定哪些变量用fisher exact检验。pDigits轻松指定结果表格中的P值小数点位数。

输出3：

                       "Stratified by Group" ""                     "level"    "对照组"               "实验组"               "p"      "test"     "n"                   ""         "  101"                "   94"                ""       ""         "性别 (%)"            "男"       "   64 ( 63.4) "       "   50 ( 53.2) "       " 0.195" ""         ""                    "女"       "   37 ( 36.6) "       "   44 ( 46.8) "       ""       ""         "年龄 (mean (SD))"    ""         "56.06 (8.60)"         "55.18 (9.06)"         " 0.488" ""         "是否饮酒 (%)"        "否"       "   49 ( 48.5) "       "   38 ( 40.4) "       " 0.313" "exact"    ""                    "是"       "   52 ( 51.5) "       "   56 ( 59.6) "       ""       ""         "病理类型 (%)"        "病理类型" "  101 (100.0) "       "   94 (100.0) "       " NA"    ""         "分化程度 (%)"        "III型"    "    4 (  4.0) "       "    7 (  7.4) "       " 0.228" ""         ""                    "II型"     "   14 ( 13.9) "       "    7 (  7.4) "       ""       ""         ""                    "I型"      "   83 ( 82.2) "       "   80 ( 85.1) "       ""       ""         "ALT (mean (SD))"     ""         "21.01 (7.08)"         "22.32 (7.92)"         " 0.224" ""         "AST (mean (SD))"     ""         "18.70 (11.87)"        "21.23 (10.18)"        " 0.113" ""         "检测 (median [IQR])" ""         "40.25 [23.00, 52.83]" "26.70 [15.21, 48.37]" " 0.009" "nonnorm"

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