r语言中c是什么函数 r语言c函数
R语言常用函数(基本)
vector:向量 numeric:数值型向量 logical:逻辑型向量 character;字符型向量 list:列表 data.frame:数据框
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c:连接为向量或列表 sequence:等差序列 rep:重复
length:求长度 subset:求子集 seq,from:to, NA:缺失值 NULL:空对象 sort,order,unique,rev:排序 unlist:展平列表 attr,attributes:对象属性
mode,typeof:对象存储模式与类型 names:对象的名字属性
character:字符型向量 nchar:字符数 substr:取子串 format,formatC:把对象用格式转换为字符串 paste,strsplit:连接或拆分
charmatch,pmatch:字符串匹配 grep,sub,gsub:模式匹配与替换
complex,Re,Im,Mod,Arg,Conj:复数函数
factor:因子 codes:因子的编码 levels:因子的各水平的名字 nlevels:因子的水平个数 cut:把数值型对象分区间转换为因子
table:交叉频数表 split:按因子分组 aggregate:计算各数据子集的概括统计量 tapply:对“不规则”数组应用函数
+, -, *, /, ^, %%, %/%:四则运算 ceiling,floor,round,signif,trunc,zapsmall:舍入 max,min,pmax,pmin:最大最小值
range:最大值和最小值 sum,prod:向量元素和,积 cumsum,cumprod,cummax,cummin:累加、累乘 sort:排序 approx和approx fun:插值 diff:差分 sign:符号函数
abs,sqrt:绝对值,平方根 log, exp, log10, log2:对数与指数函数 sin,cos,tan,asin,acos,atan,atan2:三角函数
sinh,cosh,tanh,asinh,acosh,atanh:双曲函数
beta,lbeta,gamma,lgamma,digamma,trigamma,tetragamma,pentagamma,choose ,lchoose:与贝塔函数、伽玛函数、组合数有关的特殊函数
fft,mvfft,convolve:富利叶变换及卷积 polyroot:多项式求根 poly:正交多项式 spline,splinefun:样条差值
besselI,besselK,besselJ,besselY,gammaCody:Bessel函数 deriv:简单表达式的符号微分或算法微分
array:建立数组 matrix:生成矩阵 data.matrix:把数据框转换为数值型矩阵 lower.tri:矩阵的下三角部分 mat.or.vec:生成矩阵或向量 t:矩阵转置
cbind:把列合并为矩阵 rbind:把行合并为矩阵 diag:矩阵对角元素向量或生成对角矩阵 aperm:数组转置 nrow, ncol:计算数组的行数和列数 dim:对象的维向量
dimnames:对象的维名 row/colnames:行名或列名 %*%:矩阵乘法 crossprod:矩阵交叉乘积(内积) outer:数组外积 kronecker:数组的Kronecker积
apply:对数组的某些维应用函数 tapply:对“不规则”数组应用函数 sweep:计算数组的概括统计量 aggregate:计算数据子集的概括统计量 scale:矩阵标准化
matplot:对矩阵各列绘图 cor:相关阵或协差阵 Contrast:对照矩阵 row:矩阵的行下标集 col:求列下标集
solve:解线性方程组或求逆 eigen:矩阵的特征值分解 svd:矩阵的奇异值分解 backsolve:解上三角或下三角方程组 chol:Choleski分解
qr:矩阵的QR分解 chol2inv:由Choleski分解求逆
,,=,=,==,!=:比较运算符 !,,,|,||,xor():逻辑运算符 logical:生成逻辑向量 all,any:逻辑向量都为真或存在真
ifelse():二者择一 match,%in%:查找 unique:找出互不相同的元素 which:找到真值下标集合 duplicated:找到重复元素
optimize,uniroot,polyroot:一维优化与求根
if,else,ifelse,switch:分支 for,while,repeat,break,next:循环 apply,lapply,sapply,tapply,sweep:替代循环的函数。
function:函数定义 source:调用文件 call:函数调用 .C,.Fortran:调用C或者Fortran子程序的动态链接库。 Recall:递归调用
browser,debug,trace,traceback:程序调试 options:指定系统参数 missing:判断虚参是否有对应实参 nargs:参数个数 stop:终止函数执行
on.exit:指定退出时执行 eval,expression:表达式计算 system.time:表达式计算计时 invisible:使变量不显示 menu:选择菜单(字符列表菜单)
其它与函数有关的还有:delay,delete.response,deparse,do.call,dput,environment ,,formals,format.info,interactive,
is.finite,is.function,is.language,is.recursive ,match.arg,match.call,match.fun,model.extract,name,parse,substitute,sys.parent ,warning,machine
cat,print:显示对象 sink:输出转向到指定文件 dump,save,dput,write:输出对象 scan,read.table,load,dget:读入
ls,objects:显示对象列表 rm, remove:删除对象 q,quit:退出系统 .First,.Last:初始运行函数与退出运行函数。
options:系统选项 ?,help,help.start,apropos:帮助功能 data:列出数据集分析
每一种分布有四个函数:d――density(密度函数),p――分布函数,q――分位数函数,r――随机数函数。
比如,正态分布的这四个函数为dnorm,pnorm,qnorm,rnorm。下面我们列出各分布后缀,前面加前缀d、p、q或r就构成函数名:
norm:正态,t:t分布,f:F分布,chisq:卡方(包括非中心) unif:均匀,exp:指数,weibull:威布尔,gamma:伽玛,beta:贝塔
lnorm:对数正态,logis:逻辑分布,cauchy:柯西, binom:二项分布,geom:几何分布,hyper:超几何,nbinom:负二项,pois:泊松 signrank:符号秩,
wilcox:秩和,tukey:学生化极差
sum, mean, var, sd, min, max, range, median, IQR(四分位间距)等为统计量,sort,order,rank与排序有关,其它还有ave,fivenum,mad,quantile,stem等。
R中已实现的有chisq.test,prop.test,t.test。
cor,cov.wt,var:协方差阵及相关阵计算 biplot,biplot.princomp:多元数据biplot图 cancor:典则相关 princomp:主成分分析 hclust:谱系聚类
kmeans:k-均值聚类 cmdscale:经典多维标度 其它有dist,mahalanobis,cov.rob。
ts:时间序列对象 diff:计算差分 time:时间序列的采样时间 window:时间窗
lm,glm,aov:线性模型、广义线性模型、方差
r语言中c“b”是什么型
Vectors 向量【当你想用多个元素创建向量时,你应该使用 c() 函数,这意味着将元素组合成一个向量。】
# c函数用来将元素组成为一个向量
v - c('a', 'b','c')
print(v)
# 输出结果即为元素的值,可以看出,vector类型里面只能有一种元素
print(class(v))
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1] “a” “b” “c”
[1] “character”
那么问题来了,假如我就是想什么东西都往向量里面塞呢,这种做法并不会引发报错,但是R会暗中把那些乱七八糟的东西全部转换为一种类型。比如在下面这个例子,R就取了vector的第一个元素,将其转换为了character类型。
在这里插入图片描述
Lists 列表【列表是一个 R 对象,它可以在其中包含许多不同类型的元素,如向量,函数甚至其中的另一个列表。】
# 列表里面就什么都可以塞
l - list(1,"666",c(2,3,4))
print(l)
print(class(l))
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[[1]]
[1] 1
[[2]]
[1] “666”
[[3]]
[1] 2 3 4
[1] “list”
Matrices 矩阵【矩阵是二维矩形数据集。 它可以使用矩阵函数的向量输入创建。】
# 第一个参数指的是矩阵中的元素内容,第二三个参数指的是矩阵的行和列,最后一个参数指的是按行排列还是按列排列
M = matrix( c('a','a','b','c','b','a'), nrow = 2, ncol = 3, byrow = TRUE)
print(M)
M = matrix( c('a','a','b','c','b','a'), nrow = 2, ncol = 3, byrow = FALSE)
print(M)
print(class(M))
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Arrays 数组【虽然矩阵被限制为二维,但阵列可以具有任何数量的维度。 数组函数使用一个 dim 属性创建所需的维数。】
a - array(c(1,2,3,4),dim = c(3,3,2))
print(a)
print(class(a))
print(a[2,2,1])
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Factors 因子【因子是使用向量创建的 r 对象。 它将向量与向量中元素的不同值一起存储为标签。 标签总是字符,不管它在输入向量中是数字还是字符或布尔等。 它们在统计建模中非常有用。】
color - c('green','green','yellow','red','red','red','green')
f - factor(color)
print(color)
print(f)
print(nlevels(f))
print(class(s))
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Data Frames 数据帧【数据帧是表格数据对象。 与数据帧中的矩阵不同,每列可以包含不同的数据模式。 第一列可以是数字,而第二列可以是字符,第三列可以是逻辑的。 它是等长度的向量的列表。】
BMI - data.frame(
gender = c("Male", "Male","Female"),
height = c(152, 171.5, 165),
weight = c(81,93, 78),
Age = c(42,38,26)
)
print(BMI)
print(class(BMI))
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引言 按照要求格式来创建含有研究信息的数据集是任何数据分析的第一步。在R中,这个任务包括以下两步: 选择一种数据结构来存储数据; 将数据输入或导入到该数据结构中 因此,本文将先叙述了R中用于存储数据的多种结构,具体为向量、因子、矩阵、数据框以及列表的用法。熟悉这些数据结构和访问其中元素的表述方法将十分有助于了解R的工作方式,便于后续的编程。 我将在下一篇博客介绍一些在R中导入数据的可行方法。手工输入数据当然可以,除此之外,我们也可以从外部源导入数据。数据源可以是文本文件、电子表格、统计软件和各类数据库管
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R语言中的类和对象
#####类和对象##### #之前学习的字符向量、数值向量、数据框、列表以及数组都是一个类。 #用class函数定义类 teams-c("PHI","NYM","FLA","ATL","WSN") w-c(92,89,94,72,59) l-c(70,73,77,90,102) nleast-data.frame(teams,w,l) #定义teams类 class(teams) cla
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R语言数据类型
文章目录基本概念向量字符串矩阵列表数组因子数据框 基本概念 R 语言中的最基本数据类型主要有三种:数字,逻辑,文本 逻辑类型在许多其他编程语言中常称为布尔型(Boolean),常量值只有 TRUE和FALSE。 注意:R 语言区分大小写,true 或 True 不能代表 TRUE。 最直观的数据类型就是文本类型。文本就是其它语言中常出现的字符串(String),常量用双引号包含。 在 R语言中,文本常量既可以用单引号包含,也可以用双引号包含,例如: 按对象类型来分是以下6种:向量(vector),列表(
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R语言——数据类型详解 R语言支持的数据类型 数值型 整数型 逻辑型 字符型 复数型 原生型 R语言的数据对象类型包括 向量:一个向量只能有一种数据类型 矩阵:一个矩阵只能有一种数据类型 数组:一个数组只能有一种数据类型 数据框:不同的列允许不同的数据类型 因子:一个因子只能有一种数据类型 列表:允许不同的数据类型 如上图所示,标量、向量、矩阵和数组可以按同一类型来理解,这四种类型要求对象包含的数据均为同一类型,数组是多维度的一串数据,向量是维度为1的数组,标量是单元素的向量,矩阵是维度为2的数
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R语言自用笔记:复数
介绍了R语言中虚数的表示、相关函数
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[R语言]2. R语言中的数据类型和数据结构
R语言中数据类型和数据结构是两种不同的概念,初学者经常容易搞混,因此有必要对这两个概念进行详细说明。
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R语言数据类型:Logical、Numeric、Integer、Complex、Character、Vectors、Lists、Matrices、Arrays、Factors、DataFrames 通常,在使用任何编程语言进行编程时,都需要使用各种变量来存储各种信息。变量只不过是用来存储值的内存位置或者区间。这意味着,当我们创建一个变量时,系统在内存中保留了一些空间。 我们可能喜欢存储各种数据类型的信息,如字符、宽字符、整数、浮点、双浮点、布尔等。根据变量的数据类型,操作系统进行内存的分配并
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R语言 常用数据类型
一般来讲,R语言中有三种数据结构,第一种是数组,第二种是列表,第三种是数据框。第一种: 数组(包括向量和矩阵)。数组可以用来储存数值型(numeric)、逻辑型(logical)和字符型(character)三种类型的数据。例如:储存字符型数据 x = array(rep("a",6),dim=c(2,3)) x [,1] [,2] [,3] [1,] "a" "a" "a"
R语言基础知识笔记
1、向量是用于存储数值型,字符型或者逻辑型数据的一维数组。执行组合功能的函数为c(),可以用来创建向量。向量可根据位置进行索引,需要用[]。
2、矩阵是一个二维数组,每个元素都拥有相同的模式,可通过函数matrix()创建矩阵。
3、数组是一个可以在两个以上维度存储数据的数据对象。例如,如果创建尺寸(2,3,4)的数组,那么就是创建4个矩形矩阵每个2行3列。数组只能存储数据类型。
4、矩阵和数组一样都只能包含一种数据类型,当有多种模式的数据时,使用数据框就更为方便。数据框可以用函数data.frame () 创建。
5、$ 被用来选取一个给定数据框中的某个特定变量。
6、attach()绑定数据集,detach()解除数据集。
7、with:attach,detach最好在单独的数据框内使用,在多个同名对象最好不要使用,函数with(),可以再具有多个同名对象的数据框内使用,但是必须加入花括号{},这样就无须担心名称冲突了,但是它也有局限性,赋值仅在此函数的括号内生效。
8、列表是一些对象的有序集合。
9,、数据导入 read.table(),其中header = T,代表第一行为变量名称,不作为数据,header = F相反。sep代表数据分隔符,txt为"\t",csv为","。
10、table函数,用 table() 函数统计因子各水平的出现次数(称为频数或频率)。
sex = c("女","女","女","男","男")
table(sex)
sex
男 女
2 3
求众数
aim = table(sex)[table(sex)==max(table(sex))]
aim
女
3
max(table(sex))
[1] 3
table(sex)==max(table(sex))
sex
男 女
FALSE TRUE
11、 无尺度网络: 是指在某一复杂的 系统 中,大部分节点只有少数几个连结,而某些节点却拥有与其他节点的大量连结。这些具有大量连结的节点称为“集散节点”,所拥有的连结可能高达数百、数千甚至数百万。这一特性说明该网络是无尺度的,因此,凡具有这一特性的网络都是无尺度网络。
12、options(stringsAsFactors = F)
#在调用as.data.frame的时,将stringsAsFactors设置为FALSE可以避免character类型自动转化为factor类型。
13、class():查看数据结构:vector、matrix、array、dataframe、list。
14、str():作用用英语来表示是:check classification of viriables,一般用于检查数据框当中有哪些数据。
15、mode() :查看数据元素类型。
16、typeof() :查看数据元素类型,基本等同于mode(),比mode()更为详细。
17、example():假设有一个函数foo,example("foo"),函数foo的使用示例。
18、apropos():列出名称中含有foo的所有可用函数。apropos("foo",mode="function")。
19、data():列出当前已加载包中所含的所有可用示例数据集。
20、ls():列出当前工作空间中的对象。
21、rm():移除(删除)一个或多个对象。
22、history(#):显示最近使用过的#个命令(默认值为25)。
23、options():显示或设置当前选项。有一个收藏文件有介绍options的功能。
24、boxplot():生成盒型图。
25、sum():计算和。sum(x,na.rm = TRUE)。
26、median():计算中位数。
27、cbind():以列结合变量。cbind(x,y,z)。
28、rbind():以行结合变量。
29、vector():以向量形式结合数据。vector(length = 10)。
30、rep():以矩阵形式结合数据。rep(c(1,,2,3),each = 10)
31、seq():生成一个有序的数列。seq(1,10)。
32、dim():矩阵或者cbind输出的维数。dim(Mydata)。
33、scan():从ascii文件中读取数据。scan(file = "test.txt")。
34、write.table():把一个变量写入到ascii文件。write.table(Z,file = "test.txt")。
35、order():确定数据的顺序。order(x)。
36、merge():合并两个数据框。merge(x,y,by = "ID")。
37、str():显示一个对象的内部结构。str(Mydata)。
38、factor():定义变量作为因子。factor(x)。
39、tapply():tapply(X = Veg$R,INDEX = Veg$Transect,FUN = mean).tapply函数根据第二个变量(Transect)的不同水平对第一变量(R)进行了求平均值运算。还可以求sd,var,length等操作。R语言初学者指南P75详细介绍了这个函数。
40、下一页介绍了sapply和lapply。
41、summary():计算基本信息。
42、table():计算列联表,统计因子各水平的出现次数(频数或频率)。table(x,y)。
43、plot():y对x的图形。pch形状,col颜色。
44、par():par(mfrow = c(2,2),mar = c(3,3,2,1))
mfrow生成一个具有4个面板的图形窗口。mar选项指定每个图形周围空白的大小,底部、左侧、顶部、右侧。
45、paste():将变量连接成字符串。paste("a","b",sep = "")。
46、log(): log = "x",log = "y",log = "xy",生成对数轴。
47、%in%:
a-c(1,3,13,1443,43,43,4,34,3,4,3)
b-c(1,13,11,1313,434,1)
a%in%b
# 返回内容#
[1] TRUE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE
# 取反操作
!(a%in%b)
48、sort()函数是对向量进行从小到大的排序
rank()函数返回的是对向量中每个数值对应的秩
order()函数返回的值表示位置,依次对应的是向量的最小值、次小值、第三小值……最大值等(位置索引)
arrange()函数(需加载dplyr包)针对数据框,返回基于某列排序后的数据框,方便多重依据排序。
49、subset(): df - data.frame( a = 1:10, b = 2:11, c = 3:12 )
df - subset(df, select = c(a,c)) #选取列a和c
df - subset(df, select = -c(a,c) ) #去除列a和c
R语言中的函数c中的c代表什么意思
R软件不只是一种统计工具,它还是一种语言,就语法形式而言跟S语言非常相识。所以类似与数据库一样,在客户端不是就只能调用一些函数,而是可以用数据库提供的SQL语言编写出拥有灵活多变,满足各种需求的功能。R语言也一样,可以在客户端,用S语言编写程序,传送到R软件,R软件计算完成后将结果在传回C#。既然需要来回传送,必然需要中间的桥梁,就像数据库需要驱动程序一样,在C#中调用R软件,需要安装R(D)COM,R(D)COM是一种DCOM组件,可以注册到Windows的组件服务中,供程序调用。如果用C#开发Web程序,由于ASP.NET是用ASPNET这个用户在执行,而这个用户的权限很低,所以如果要调用R(D)COM的服务的化,需要给ASPNET授予权限。所有具体的操作,使用方法,可以参考:/KB/cs/RtoCSharp.aspx
R语言数据结构-向量
R语言数据结构主要有以下四种:
向量:一串相同类型的数据,不限于数字,字符,逻辑都可以,单独拿出来的一列。什么是看做一个整体,一个向量里有若干个数据,它们组成一个整体之后,可以拥有一个共同的名字。
以下主要讲向量:
向量就是一串数据,串联在一起,组成一个整体,向量由元素组成。
很长的向量要么从数据框提取一列,或是有规律地生成,如连续的数据:
paste0函数连接两个向量,逗号 , 前后各有一个向量,如字符型和数值型向量。
paste0和paste的区别是:
paste0函数 把两个向量的元素一一对应进行 无缝 连接,而 paste函数 把两个向量的元素一一对应进行 空格 连接。paste函数有默认值为空格,在空格处把空格去掉sep=""引号里把默认的空格去掉,即什么没有,就变成无缝连接,也可以用其它的符号连接sep="/",sep="_"等。
数值型、字符型、逻辑型:只要有字符型在,用c()生成向量为字符型。只有逻辑型和数值型,用c()生成向量为数值型。
c()函数生成向量时,要求为生成同一种数据类型
注意的地方:
变量名 :c()为生成向量函数,一般除字母c外,取单个字母或是单词及缩写,组成变量名的字母之间不要有空格,不能以数字为变量名或是以数字开头,变量名不能是中文名,特殊符号等。
- 与c()函数之间没有空格。
- 的快捷键输入:
mac电脑: option 和 - ;
windows电脑: Alt 和 -
= 在任何情况下可替代 - ,但是 = 除了赋值,还有其它用法,比如函数里参数用法。 - 不能在任意情况下代替 = 。
强大的计算是体现在批量计算上,先把一些数据组成一个整体,
还是以向量x为单位进行
其中五个重要函数,一定要掌握。
能用函数代替的东西,坚决不用手和眼睛去数,比如length()统计向量元素个数。
结论:unique(x)与x[!duplicated(x)]函数相同
用identical()可以判断两个函数是否相同(数据结构与数据类型是否完全相同)
重点和难点:
x==y :x和对应位置的y相等吗?(x和y里的元素,按顺序一一对应比较,讲究位置对应,两者里第一个元素相同就返TRUE,比较完两个向量的第一位置上的元素,接着比较两个向量第二个位置元素...到两个向量最后)。
x和y不一样长:理解“循环补齐”
结论: 如果x与y的向量元素长度不相等,以长度向量说了算,不是由在==前的向量决定。
x%in%y :x的每个元素在y中存在吗?(x的元素挨个到y里和所有元素比较,在y里有的相同的返回TRUE,不讲究位置,有就是TRUE,没有为FALSE)。比如y向量加了一个元素2,返回还是9个逻辑值,返回的逻辑值是与x一一对应,和y没有关系。
加减乘除,两个向量直接可以进行,等位运算。前提是两个向量必须等长,即元素个数一样。
用paste0或是paste连接两个向量,两个向量的长度(元素个数)不一致,循环补齐。
intersect(x,y),union(x,y),setdiff(x,y),setdiff(y,x),x与y顺序颠倒(setdiff()与%in%有点儿相似)。
[] :取子集符号,将TRUE对应的值挑选出来,FALSE丢弃.
例:在13个数中,取出大于7的数,首先把13个数值组成一个向量x,x7返回是逻辑值。
取值子集的对象放在中括号的外面,取子集的逻辑值向量放在中括号里面。
单独运行中括号里的向量,中括号里各种条件的返回结果有共同的规律,是一个与x等长的逻辑值向量。
下标:代表在哪个位置上。
符号 : []
按照逻辑值: 中括号里是与x等长的逻辑值向量
按照位置: 中括号里是由x的下标组成的向量(支持反选)
思考:从13个彩色(绿,蓝,黄)球中,选出属于蓝色和绿色的:
使用x %in% y还是x ==y,用x %in% y,不是等位循环补齐运算,%in%比较灵活,可以在很多场景中使用,如3选2,50选2,50选20等。
13个球的颜色赋值给向量x,蓝色和绿色赋值给y。
x %in% y
x[x %in% y]
修改向量的元素,修改x里的第四个元素
注意:R于语言里所有的修改,都要赋值,没有赋值就是没有发生过
把随机函数生成的数永远为一组数据:用随机函数生成向量,后运行set.seed(10086)
x[match(y,x)] 和 x[order(x)]
排序,如何调整元素顺序
结论:sort(x)等于x[order(x)],背诵下来
两个向量没有做关联的操作,可以用order函数排序对应信息
向量匹配排序-match,match函数是连线用的
x[match(y,x)] 的以后用法:以y作为模版,给x调顺序。
match:谁在中括号外面,谁就在后面, x[match(y,x)] ,以y作为模板,用x作为原料去取子集,按照一个顺序取子集,取出来的子集和y一样。
需要背诵的两个用法: x[match(y,x)] 和 x[order(x)]
练习题:在以下x和y表格里如何将y的列名一对一替换为ID
切换Rproj的时候出现弹窗:是否将工作空间保存到 .Rdata ?
答案是:不保存,之前单独保存好脚本和图片,这里出现的提示是否临时保存,不需要保存。
.Rdata ?是什么:
以 . 开头的文件,通常用作配置,系统默认隐藏这类文件
.Rdata 是保存工作空间的默认文件
.History 是保存历史命令的默认文件
如果打开Rstudio特别慢,可能是因为 .Rdata 保存了很大的变量,可以找到 .Rdata 文件将其删除。
在Rproj右下角打开脚本时,编辑器脚本的中文注释出现乱码,解决如下:
以上内容是听 生信技能树 小洁老师的 R语言线上课 ,根据自己的理解记录下来,小洁老师授课非常细心,对不同水平的同学都照顾到,并且补充很多技巧以及注意事项。
之前学习过R语言,那时对向量认识不够深,也没有重视,数据框的列单独拿出来就是一个向量。认真听小洁老师的讲解以及最近跑几个GEO数据集发现学会对向量的熟练操作以及熟练一些重要的函数,在实战过程中会顺利些。
r语言中xlim=c(0,30)是什么意思?
xlim可以用于plot函数作图,它的意思是xlim = c(min, max)。就是说缩放函数的x轴,范围在min与max之间。
如题中xlim = c(0,30) 就是将图像放至0到30间来看函数的图像。
请问,您懂了吗?
标题名称:r语言中c是什么函数 r语言c函数
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