[R语言] GO富集分析可视化 GOplot::GOCircle

查看GOplot内示例数据的格式，对自己的数据做处理

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观察结论：

观察自己的两个数据表：

table.legend 设置为T时会显示表格

本图中表格和图例是出图后剪切拼合而成，没有用R中的拼图包

R语言可视化及作图7--ggplot2之标签、图例和标题绘制

R语言绘图系列：

使用geom_label绘制标签散点图

绘制点，并通过nudge参数对标签进行x轴和y轴上的平移

使用angle参数对标签角度进行设置

geom_label可以使用fill对颜色进行填充,fontface设置字体，geom_text不能填充颜色

parse参数意思是前面传入的是一个数学表达式，size定义标签相对大小。

画一个散点图

annotate函数传入标签

添加矩形

添加短线段

2.1 guide_legend函数（主要参数：color, shape, size）

图例调整函数也属于标度函数的一类，但不可以直接使用加号来连接，必须放在函数中，作为一个参数。

guide_colorbar和guide_legend设置的是不同的图例，guide_colorbar定义色条图例，guide_legend定义普通图例。

2.2 标度函数scale

对于连续型变量，使用的参数是scale_xxx_continous()，对于分类型变量，使用的是scale_xxx_discrete()。

2.3：theme函数

在theme函数中，与图例有关的主要参数有：

标题主要有五种：主标题，副标题，角注，x轴标签和y轴标签

ggtitle()只能定义标题和副标题，默认的位置在左上角。

R语言可视化常用代码

（供自己记录）

adj位置调整

ask询问

bg背景

bty图形边框风格，o四边都有边框，l左边和下边，7右边和上边，c上边、左边和下边，

cex设置点和字符的大小，axis坐标轴上标签字的大小，lab坐标轴上命名的大小，main标题的大小，sub副标题的大小，col颜色。

family字体的风格，

fg前景颜色

font图片字体的风格，字体，粗体，斜体

las坐标轴的运行关系，坐标轴上的字和坐标轴的关系，字会转

lend线的两端的样式

lty线的形式,直线、虚线

lwd线的粗细

Mai、mar、mex画布的大小

Mfcol、mfrow是来切分画布的，放几个fig在画布中，两个功能一样

pch是用来定义点的形状的，有25个形状

srt用来定义图中的文字的角度

Txk坐标轴上的刻度的大小，刻度的字体大小

Xaxt/yaxt不想要坐标轴的标签

Xlog/ylog是x轴和y轴设置为log值

Xpd把绘图区设置为整个画布

Fig表示图形的四个角的位置

New是在图中生成图

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